Sì, talvolta l'indentanzione nel codice sorgente può provocare dei problemi in fase di rendering nel browser. Ma il problema si è verificato solo su IE oppure anche su navigatori basati su Mozilla? Spesso i problemi, comunque, li dà caca-IE.
Ci sono altre occasioni in cui si verificano problemi di questo tipo e qui c'è un esempio:
- www.alistapart.com/articles/multicolumnlists
Non essendo esperto dei motori di rendering dei browser credo di poter appoggiare la spiegazione fornita dall'autore dell'articolo.