Non credo esista una statistica ufficiale dell'utilizzo maggiore o minore dei due linguaggi; in senso assoluto, credo che tu possa tranquillamente scegliere quello che preferisci.

Magari C# ha qualche "feature" in più, però con qualche libertà in meno rispetto a VB.NET; C# ha più punti in comune con altri linguaggi (es. Java) mentre VB.NET no.

In parte, dipende anche dal modo in cui fai uso di questi linguaggi di programmazione.

Almeno per quanto riguarda il .NET Framework, credo sia importantissimo conoscere gli aspetti tecnici della piattaforma in sé piuttosto che il linguaggio.

Ciao!