Ho trovato la risposta, la pubblico sperando che sia utile a qualcuno.

Quindi per trovare il selectedValue di una combo facendo la scansione dei controlli in una form bisogna usare questo:

CType(CType(cntr.Controls(a), System.Windows.Forms.Control), System.Windows.Forms.ComboBox).SelectedValue

dove a è l'indice di scansione e cntr è l'insieme dei controlli presente nella form.