Dato che sono in locale devi puntare i link alle pagina in modo relativo cioè niente file:// etc, ma come dice federix
metti il percorso relativo da dove si trova la pagina coi link ad dove si trovano le pagine a cui punti con gli anchor link.

se hai un file pagina.html sulla scrivania del tuo mac, e hai due cartelle "sito1" con dentro il file paginasito1.html con ancora #ancorasito1 e la cartella "sito2" con un file paginasito2.html con ancora #ancorasito2

dovrai mettere nei link del file pagina.html sulla scrivania i riferimenti così:

<a href="sito1/paginasito1.html#ancorasito1">

e

<a href="sito2/paginasito2.html#ancorasito2">

più chiaro?

è ovvio che quando andrai online se sito1 e sito2 vanno su siti/domini diversi una volta online dovrai correggere i link nella pagina.html inserento i domini di riferimento tipo:

<a href="http://www.sito1.it/sito1/paginasito1.html#ancorasito1">

e

<a href="http://www.sito2.com/sito2/paginasito2.html#ancorasito2">