non ci ho mai provato ma dovrebbe funzionare:

finestra = window.open(...);

codice:
if (finestra.document) {
   /* riesco a leggere l'oggetto document*/
}
else {
   /* non leggo l'oggetto la finestra non c'è */
}
forse funzia anche con solo

codice:
if (finestra) {
  ...
}
prova un pò...