Se scrivi

MA[i, j] al posto di MA[i][j]

il compilatore considera solamente l'ultimo indice ignorando tutto quello che c'e' prima.

Questo equivale quindi a

MA[j]

e considerando che MA e' una matrice, quello che vedi sono i puntatori alle colonne (i valori degli indirizzi delle colonne).

La cosa importante e' che stai facendo un errore piu' "grave" ... gli indici dei vettori in C iniziano da 0. Quindi, i cicli ne devono tenere conto ed essere

for (j=0; j<m; j++)
for (i=0; i<n; i++)