Succede quello che hai detto.
A mio avviso è del tutto regolare, ed è un compooortamento che riscontro, se non ricordo male, dalle prime release 1.x di mozilla.
Il copia-incolla in ambiente grafico con linux, funziona sommariamente in questo modo:
- selezione del testo con il tasto sinistro
- inserimento/copia del testo precedentemente selezionato, con il tasto centrale.

Normalmente quando si preme il tasto centrale su un link di una pagina web, questa, verrà aperta in una nuova tab del browser. Facendo click in un punto 'vuoto' della pagina web, verrà ricercata l'ultimo brano di testo selezionato con il mouse, restituito il primo link.

Esempio:
da questa pagina, seleziona Linux dal 'percorso' del forum, nella parte alta di questa pagina:
HTML.it forum > Sistemi Operativi e Software > Linux > [pseudoOT] strano comportamento di Firefox sotto Breezy

A questo punto clicca con il tasto centrale in un punto vuoto della pagina, ti verrà restituito un risultato.

Ora, in un altro tab, accedi a www.google.com e ricerca "Linux", ovvero la stringa che abbiamo selezionato prima.

Confronta i risultati restituiti, dovrebbero corrispondere.

spero di avere fatto un poco di chiarezza...

ciao