si, dovrebbe essere cosi per avere una maggiore separazione e anche una maggiore portabilità

il PDO di antrea è simile a AdoDB ma MOLTO più leggero oltre che completamente compatibile con PDO di php 5.1 di conseguenza usando php 5.1 trai il vantaggio della velocità di esecuzione dato che è un'estensione

inoltre ti sconsiglio anche di pensare di usare AdoDB perché è disunanimamente pesante!