non so se e' quello che cerchi.
io le popup le faccio cosi
window.open("pagina.php","nome","width=400,height= 300,left=500,top=500,toolbar=no, location=no,status=no,menubar=no,scrollbars=no,res izable=no");

vedi se e' come vuoi te.

per quanto riguarda il blocco delle popup non credo si possa forzare, dovresti creare te la finestra.....se usi window.open si puo bloccare...
avevo visto qualcosa come le chromeless.
http://pro.html.it/articoli/id_362/idcat_11/pro.html

quelle mi pare che non vengano bloccate.