Io ho installato la versione wine 0.20050725-1.rhfc4.nr e winetools 0.9-3jo.
sul sito di winetools c'è una tabella che spiega gli abbinamenti consigliati tra le versioni di wine e di winetools

Potrei aver sbagliato l'ordine di installazione dei vari elementi di winetools???
io ti consiglio di seguire rigorosamente l'ordine con cui sono elencati in winetools: inizialmente ho avuto dei problemi perchè andavo un po' a casaccio.

Per resettare il tutto basta che disistalli i pacchetti o devo fare qualche altra cosa??
la via più brutale per resettare il tutto è cancellare la cartella .wine nella tua home directory (che contiene tutta la configurazione e i programmi istallati) e la cartella winetool, ancora nella tua home (che contiene i file di istallazione scaricati).
Se questo non bastasse, prova a istallare una versione di wine che si abbini bene con quella di winetools