Allora c'è da implementare un appropriato tablemodel. JTable è, purtroppo, uno dei più complicati componenti di Swing... c'è diverso materiale sia qui sul forum, che nel tutorial su Swing al sito della sun:

http://java.sun.com/docs/books/tutor...nts/table.html

EDIT: tra l'altro, proprio nel tutorial della sun, c'è un esempio con delle checkbox nella jtable stessa... mi sa che ti è andata di lusso