Prima di tutto leggi questa FAQ:
http://flash-mx.html.it/faq/view_faq.asp?idcat=4&id=27

Poi porta il frame rate a 24fps (il + vicino a qello percepito dal nostro occhio).

Infine... cambia PC
Scherzo ovviamente, però può dipendere anche da una CPU non proprio all'altezza.

Ah, dimenticavo, non sarà per caso che, oltre al movimento, fai anche qualche giochino con l'alpha (trasparenza)?