il programma in questione può essere avviato con qualsiasi utente ma funziona correttamente ed è stato configurato solo per l'utente root
non è che è stato configurato per l'utente root.
semplicemente per l'esecuzione (per le operazioni che evidentemente svolge) ha necessità di avere i privilegi di amministratore.

lo puoi fare eseguire da qualsiasi utente, e come ti è stato correttamente suggerito per fare questo basta che imposti correttamente la configurazione del programma sudo (nel quale puoi anche indicare di non richiedere la password).

oltre al link suggerito (se questo non ti chiarisse a suffucienza le idee) in rete trovi quintalate di esempi e informazioni in proposito. leggi leggi leggi.