se vuoi fare un backup del tuo database, ti consiglio di guardare come fa phpMyAdmin. Non ricordo esattamente come ma puoi fare un backup dal suo menù. Questo consiste nella creazione di un file testo con su le query e i valori di tutti i campi del db.

Ci sono molti modi per fare il backup.... Personalmente userei quello del file di testo opportunamente formattato.

Spero di esserti stato utile...
ciao