beh ... non credo esista un connettore specifico per il .NET comunque sicuramente ti ci puoi connettere con l'odbc

http://www.15seconds.com/issue/030623.htm
http://uda.openlinksw.com/ado.net/mt/dotnet-db2-mt/

comunque se non erro i driver di collegamento, come anche i provider, sono diversi ma le feature esposte dovrebberò essere uguali quindi ti basterebbe, se necessario, cambiare soltanto il sistema di connessione