Se ho ben capito hai il problema di formattare in fat32.
Dimentica xp e spiega perchè non riesci a formattare con il dischetto di win98.

Se ti occorre qui puoi scaricare un disco per avviare dos e fare tutte le operazioni che ti servono edit, debug, scandisk, chkdsk, fdisk, format, ecc.
http://msni.150m.com/dload2/disco_dos.zip