definisci una variabile che individua l'oggetto form:
var ff = document getElementById('ID_FORM'); // o altro metodo

Poi la cosa e` facile:
codice:
  var cc = ff.elements['check[]']; // vettore contenente tutti gli elementi con lo stesso nome
  // eventualmente testare che sia veramente un vettore
  for(var i=0; i<cc.length; i++) {
    cc[i].checked = true;
  }