Ciao! Anch'io ho avuto questo problema, poi chiedendo su questo forum ho trovato la soluzione... in HTML 4.01 Transitional prova ad inserire gli SWF con questa dicitura:

codice:
<object type="application/x-shockwave-flash" data="nome_file.swf" id="nome_id" width="larghezza" height="altezza">
<param name="movie" value="locazione_file.swf">
<param name="wmode" value="transparent">
<param name="bgcolor" value="#000000">
<param name="quality" value="high">
</object>
non dovresti più avere problemi con il W3C.
Ciao!!!