Per quanto riguarda le tue carenza in javascript non preoccuparti..meno si usa meglio é..e poi navigando si trova sempre qualcosina..
Il php lascialo stare a chi si occupa di php..rischieresti di saper fare tante cose ma non al meglio..
Pe rquanto riguarda la grafica vettoriale io utilizzo Freehand e Illustrator..tra le altre cose fonti poco certe dicono che freehand cesserà di esistere visto che Adobe ha acquistato Macromedia..quindi mi butterei su Illustrator..scegli solo da dove partire.