Yes. Naturalmente l'exe girerà solo su windows. Se deve essere letto anche da mac devi pubblicare il file direttamente da mac (quindi devi avere un mac con flash installato) oppure pubblicare da windows la versione per mac, portare il file ottenuto (.hqx) su mac e da qui estrarlo (se non ricordo male con Stuffit). Gli swf sono invece multipiattaforma, quindi non necessitano questa operazione.
Ciao ciao