Bhe, di versioni di mysql non ne capisco molto ma questa è un asemplicissima query che non dovrebbe dare particolari problemi: non ci sono sub queries ne' particolarità che possano far sorgere dubbi. Magari se posti un dump del db e la query interessata posso fare delle prove io per capire se è un problema di query o un problema di installazione magari o qualunque altra cosa.
Ovviamente non postare l'inetero db ma solo il codice per creare la tabella, qualche riga del db e la query incriminata.