Non è assolutamente detto che funzioni (tra l'altro non conosco l'applet in questione), però potresti provare in questo modo:

Aggiungi una funzione del tipo
codice:
function myopen(url, name, feats) {
  window.open(url, name, feats);
}
in un blocco script nell'head del documento html che contiene l'applet.

Serve poi modificare i parametri dell'applet in questo modo
codice:
<param name="url0" value="javascript:myopen('http://www.sito.com','mywindow1','height=480,width=640')">
E pregare che vada

PS: ricomponi la parola "javascript" che il forum spezza.