credo ti convenga inclduere il file con il path assoluto,
e di ricavartelo da realpath:
il codice:
codice:
include_once (realpath(dirname(__FILE__))."/sottocartella/file_da_includere.php");
dovrebbe funzionare sempre...

PS in realtà
dirname(__FILE__)
realpath(dirname(__FILE__))
mi danno lo stesso risultato