ho capito..
non l'ho mai usato (lo sto scaricando giusto ora per provarlo) e quindi non so darti una risposta precisa.. cmq per altri linguaggi ce ne sono un sacco di framework (phrame.org, xoad.org) ma non penso facciano al caso tuo e siano meglio di FileMaker..
Ma FileMaker non produce codice php editabile? E' protetto?