per kde o gnome prova a reinstallarli se l'installazione non è andata a buon fine

apt-get install kdebase ti installa il minimo per far partire kde apt-get install kde ti installa kde
per poi ricompilare il kernel ti servono anche i vari
make gcc cpp g++ binutuls libncurses5-dev se scarichi il sorgente

per installare i moduli comunque con i precompilati bastano i kernel-headers o linux-headers esatti della versione del kernel