il problema ti si presenta perchè la copia di w98se che stai utilizzando è OEM.
riassunto in breve di licenza OEM : "questo software viene fornito assieme ad un prodotto hardware nuovo, non è utilizzabile su altre macchine ed alla sostituzione dell'hardware ad esso associato anche il software va eliminato. L'installazione dello stesso su un altro hardware costituisce una violazione della licenza."

Questo vale per i sistemi operativi, ma anche per i pacchetti office ecc.
Nel tuo caso provando a reinstallare un win su una precedente versione l'installer si accorge, a causa della presenza di una vecchia versione di win che stai tentando l'installazione su un pc non nuovo e quindi in palese violazione della licenza.

L'unica soluzione è quella di installare su un nuovo HD vuoto(in questo modo il pc viene riconosciuto come nuovo), mettendo come slave il precedente disco, oppure eseguire l'installazione con una copia win con licenza valida (non OEM quindi).


Un altra alternativa potrebbe (ma non garantisco) essere quella di aggiornare il sistema tramite un update pack rilasciato da M$.