Hai guardato nel pannello di controllo del tuo spazio che non vi sia la possibilita'di di proteggere le cartelle?

Se ad esempio proteggi la cartella download, e qualcuno tenta di accedervi verra'richiesta la password.

L'unico incoveniente è che non puoi fare direct link al singolo file (a meno che non crei per ogni file una cartella) ma cosi'facendo accederanno a tutto il contenuto della cartella download.

O se no in google di howto in php ne trovi a iosa..