quando usi imagecopyresized, dici anche di selezionare un rettangolo dell'immagine originale, e lo fai dando le coordinate del rettangolo che coincidono con tutta l'area disponibile dell'immagine originale. Guardati la documentazione di quella funzione e troverai quello che cerchi. Poi dovrai calcolarti le coordinate del rettangolo 100*100 al centro dell'immagine