window e' il livello globale delle variabili.
facendo un paragone con le cartelle, equivale a ./
quindi metterlo o non metterlo e' praticamente quasi uguale.
esempio:
var foo = 'hello world!';
// questi 4 alert fanno tutti la stessa cosa
alert(foo);
alert(window.foo);
window.alert(foo);
window.alert(window.foo);