Se ho capito bene il tuo problema avrai la tua lista di record ciascuno col suo checkbox.

Quindi recuperi via post i record selezionati
$selezionati = $_POST['record'];

Tramite implode li separi con la virgola

$aggiorna = implode(',',$selezionati);

e poi esegui la tua query di aggiornamento

update tabella set campo = 1 where id in ('$aggiorna');