Visto che non sono esperto di FTP: puoi usare PHP SICURAMENTE se c'è un'opzione HTML tipo
codice:
<a href="ftp://example.com/file.txt/" name="utente" password="password">
Se fosse così, sarebbe sufficiente fare scrivere al PHP "utente" e "password" pescando da variabili o cookie.

Ma non so se esista qualcosa di simile...
Se no, non vedo una soluzione: bisognerebbe che PHP montasse un estenzione per "FileZilla", penso... se esiste...