Beh devi solo togliere l'indicatore static nell'intestazione del metodo e poi quando lo vuoi usare devi prima creare un oggetti del tipo della classe che lo contiene, ad esempio in un'altra classe in cui devo usare il metodo dovresti fare: (tutto all'interno del main)

codice:
addtodb ogg = new addtodb();
ogg.fileLength(f);
Nel tuo caso mi pare di capire che hai tutto nella stessa classe...non so quanto può essere utile una cosa del genere...comunque ti resterebbe una cosa così :master:

codice:
import java.util.*; 
import java.io.*; 


public class addtodb { 
/** 
* @param args 
*/ 
public int fileLenght(File f)throws IOException {  
int row = 0; //inizializzo il numero di righe 
int columns = 0; //inizializzo il numero di colonne 
FileReader file = new FileReader(f); 
BufferedReader br = new BufferedReader(file); 
String line = br.readLine(); 
StringTokenizer st = new StringTokenizer(line); 
System.out.println("Il numero di colonne e' :" + st.countTokens()); 


while (line != null) { 
row++; 
line = br.readLine(); 
} 


System.out.println("Il numero di righe e' :" + row); 
return 0; 
} 
public static void main(String[] args)throws IOException {
addtodb ogg = new addtodb(); 
File f; 
f=new File("Affymetrix_dati.txt"); 
try{ 
System.out.println(ogg.fileLenght(f) ); 
} 
catch(IOException e){ 
System.out.println(e.getMessage()); 
} 
}
}
Il problema è che ti da questo errore perchè in un metodo static (cioè il main) puoi usare solo metodi o variabili che sono a loro volta static. Se dichiari una variabile in un metodo static viene implicitamente creata anchessa static anche se non lo scrivi esplicitamente, questo però non vale per i metodi e le variabili globali che crei fuori dal metodo.

Se non ti crea problemi io lascerei il metodo static...

Ciao.