per fare quelllo che vuoi tu non ci vuole solo php ma anche javascript:
alla checkbox metti l'atributo onclick e associagli uan funzione che richiami lo scripphp e gli dica di usare la funzione imap_delrte() (potresti usare qualcosa tipo ajax per questo, così qunado lo presenti fai una figura milgiore)
metre per il messaggio di conferma ti basta fare un if così:
if(confirm('sei sicuro?')){
//codice da eseguire in caso di risposta affermativa
}else{
//codice da eseguire in caso di risposta negativa
}