scusa..non ho capito bene...tu al posto di
http://sito.it/cartella/index.php
vorresti far apparire
http://cartella/sito.it/index.php
?
questo non lo puoi fare, se invece intendevi questo:
http://cartella.sito.it/index.php
allora devi abilitare le wildcards sul tuo server dns, ma sinceramente non so cosa devi scrivere nello htaccess