Il fatto che il PROCESSO di apache giri come utente non privilegiato,Originariamente inviato da kylnas1
Scusami ma ho detto che apache non viene avviato da root...
Edit:
User e Group all'interno del file httpd.conf non sono l'utente root
non implica che il servizio sia stato avviato con tale utente.
Da root, stoppa il servizio, cancella i files poi loggati con l'utente i questione e riavvia il servizio.
Altrimenti lancia da root il processo facendo le veci di quell'utente (su - $user -c $comando).