OK, direi che ci siamo. Come ti sembra che vada il PC adesso?

Se vuoi puoi cancellare, come ti faceva notare Simeon anche la voce
O4 - HKLM\..\Run: [Alcmtr] ALCMTR.EXE

E' installato insieme a prodotti hardware Realtek. Alcuni lo considerano una specie di spyware che raccoglie informazioni sui clienti Realtek, secondo altri invece no. Comunque non è essenziale al sistema, se vuoi quindi lo puoi togliere dall'avvio.

Ora che sei a posto, cancella i backup creati da HijackThis, cioè svuota questa cartella: C:\Programmi\hijackthis\hijackthis\backups

Poi se non ce l'hai, scaricati CCleaner ed esegui una bella pulizia completa del PC selezionando tutte le voci.

Ciao