Per adesso credo che l'uso di AJAX sia rivolto preferibilmente al backoffice o comunque ad applicazioni online più che a pagine di contenuti (che quindi necessitano di indicizzazione da parte dei motori di ricerca, al contrario delle prime).

A mio parere gli svantaggi nell'indicizzazione sovrastano decisamente i vantaggi di navigabilità che può offrire, sempre in riferimento a pagine sostanzialmente di contenuti.