ma ti è proprio necessario serializzare anche il FileReader? Potresti escludere dalla serializzazione specificando l'istanza con transient e dopo aver deserializzato chiamare un metodo che ricrea il FileReader.
Se invece devi salvare per forza il FileReader e/o ciò che dico non è del tutto giusto, ci penso e vedrò se mi viene in mento qualcosa.