Guarda, io uso Cobian Backup 7.
E' anche in italiano, puoi fare backup completi, incrementali, differenziali ecc... io lo uso per le sue funzioni base e mi ci trovo strabene.
In pratica il primo backup lo fai completo per le directory che vuoi. LUi ti fa una copia dei files in quelle cartelle, ogni quando vuoi (io lo faccio settimanalmente) mettoil mio hard disk esterno e gli dico di fare il backup incrementale per cartelle delle quali ho fatto il backup completo. In pochi minuti mi controlla tutti i files e mi fa il backup di quelli creati/modificati.

Ma questo è uno dei tanti che puoi trovare...

ps. è freeware.