Originariamente inviato da silverwings
Leggendo il tipo di tabelle mi dice myISAM non so se tu ti riferisca a questo comunque tengo a specificare che per circa un mese i file erano 3 per tutte le tabelle poi sono inspiegabilmente sono scomparsi 2 file in un db a una tabella in un'altro su tutte.
Sostanzialmente nel phpmyadmin vedevo la lista delle tabelle sulla sinistra e cliccando sopra una di queste mi dava un errore appunto di missing dei file in questione.

Tramite sql non credo sia possibile eseguire una cancellazione di questo tipo e poi se anche ci fosse una injections avrebbe cancellato dei record o tutta la tabella...
se sono myisam sono tre file per tabella.

.frm -> struttura
.MYI -> indici
.MYD -> dati

dovresti verificare se i file non esistono fisicamente.... oppure se solo non sono visibili perche' corrotti. Prova anche con REPAIRE TABLE tabella.