Alcune annotazioni...
codice:
<script>

stringa = "1234,597";

destra = parseInt(stringa.split(",")[1],10)
if (destra>59) alert("troppo 1")

// Ma ovviamente stai parlando di decimali... e se le cifre sono piu' di due sballa tutto.

// Puoi seguire due strade: confrontare l'intero con il numero a cui avrai aggiunto .41

valore = parseFloat(stringa.replace(",","."));
if (parseInt(valore) < parseInt(valore+.41)) alert("troppo 2")

// Oppure considerarla una string...

if (stringa.split(",")[1] > "59") alert("troppo 3")

</script>
ciao