qui trovi come leggere un file riga per riga
http://www.javastaff.com/article.php...50429090542890

codice:
while(linea!=null) {
righe.add(linea) //per agg all'array
       System.out.println(linea);
       linea=br.readLine();
}
per saltare la prima linea puoi inserire un contatore e agg all'array solo se è diverso da 0 o 1 dipende da come lo inizializzi.


per popolare l'array righe
codice:
righe.add(String riga);
per leggerle dall'array
codice:
String s1 = (String)righe.get(0);
String s2 = (String)lista.get(1);