Presupponendo che tu abbia il tuo file java con il codice i passaggi da fare sono due (di cui il primo sai già che fare):

Primo passaggio:

codice:
javac nomeFile.java
In questo modo ottieni il file .class relativo al tuo file java

Secondo passaggio:

codice:
java nomeFile
Notare che qui non devi indicare l'estensione perchè ti stai riferendo al file class che deve essere eseguito e non compilato come nel passaggio precendente.

Ciao.