nono...
fai partire l'installazione di XP, crei la partizione da 20 Gb e ci installi sopra windows (gli altri 20Gb lasciali cosi, non li toccare).
Quando windows è installato, per creare l'altra partizione vai su:
Risorse del Computer -> click dx -> Gestione
Vai su "Gestione Disco", selezioni i 20Gb vuoti (non partizionati), clicchi di dx e vai su "nuova partizione"...ti si apre in automatico la procedura guidata di creazione di una nuova partizione.
Ti consiglio di creare una partizione primaria. Dopo che hai creato la partizione, clicchi di destro e fai formatta, scegli il filesystem (FAT32 o NTFS) e fai partire la formattazione!