Nessun OS linux ti dà la possibilità di scrivere su NTFS (se non con procedure che esplicitamente dicono che potresti mandare tutto a marengo, almeno a quanto ne so io), e di tool freeware che scrivano su ntfs non mi risulta ce ne siano.

Potresti probabilmente scaricarti i 4 dischetti di avvio di win2k dal sito di MS e provare ad accedere alla console di ripristino da lì...altrimenti prendi l'hd e lo metti sun un pc con windows2k/XP funxionanti