l'hostname definito in /etc/hostname è il nome della macchina, fine; non c'entra nulla col fqdn, quello lo devi mettere in /etc/hosts:
codice:127.0.0.1 localhost.localdomain localhost 80.1.1.1 mail.tuodominio.it www.tuodominio.it ftp.tuodominio.it [bla bla bla] nome_macchina