Ad esempio:
<script type="text/javascript">
document.write('\<link type\=\"text\/CSS\" href\=\"CSS_JS\.css\" \/\>');
</script>
<noscript><link type="text/CSS" href="CSS_NO_JS.css" /></noscript>

Oppure (piu` pulito):
<link type="text/CSS" href="CSS_SEMPREE.css" />
<noscript><link type="text/CSS" href="CSS_NO_JS.css" /></noscript>

dove in quello nel <noscript> ridefinisci tutto cio` che non va nell'altro