Il layout fisso va bene fino ad un certo punto. se hai un layout molto grande non puoi dare 900px a un box. se dai invece un 90% le cose vanno sicuramente meglio, perchè cambia e si adatta alle dimensioni della finestra. stessa cosa con gli em. è una questione di flessibilità. la risoluzione base è 800x600, ma in condizioni particolari un utente può anche decidere di scendere a 640. senza contare poi i palmari e i cellulari.

ps. io con FF lo vedo bene l'esempio.