Non mi interessano moltissimo le funzioni che citi, quindi non mi sono mai andato ad informare o a smanettarci su, ma VLC ha pannelli di configurazione molto complessi nei quali, con tutta probabilità potresti trovare quello che cerchi.

Il mio consiglio è: prova

Detto questo, mi sembra sempre più plausibile che sia un problema di lettore, visto che mi dici che ti presenta il difetto anche con lo stesso DVD.