Anzitutto attento ai titoli: che tu fonda o meno non aiuta a capire il problema.

Poi non hai postato il codice HTML (cosa che impedisce di capire cosa esattametne hai), e comunque non usi strutture corrette: una lista si fa con <ul> e[*].
Per poter sistemare i margini, conviene usare strutture rigide (blocchi), non cose elastiche (inline): in tal senso il[*] e` meglio del semplice <a>

Ma la soluzione nel tuo caso e` banale: metti un px di padding in alto al blocco, poi metti un px di margine in basso ad ogni struttura interna
(il padding del blocco contenitore corrisponde al margin del blocco contenuto).